Ein neues Werkzeug zur Genom-Analyse unterschiedlicher Bakterien könnte helfen, bessere Antibiotika zu entwickeln


  • Priscilla Lynch
  • Medical News
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US-Forscher haben mit dem Genrepressions-Werkzeug CRISPRi (clustered regularly interspaced short palindromic repeats interference) untersucht, auf welche Gene bestimmte Antibiotika abzielen, um so Informationen zu liefern, mit denen verfügbare Antibiotika verbessert oder neue entwickelt werden können.

Um CRISPRi mobil zu machen, übertrugen die Forscher das System von üblichen Labor-Modellen wie E. coli auf pathogene Spezies in einer Reihe von CRISPRi-Systemen, bei denen Modularität, stabile Genom-Integration und Leichtigkeit des Transfers per Konjugation zu unterschiedlichen Bakterien kombiniert sind.

Mobiles CRISPRi ermöglicht die genetische Untersuchung von Nicht-Model-Bakterien, erleichtert Analysen der Mikrobiom-Funktion, der Antibiotika-Resistenzen und -Empfindlichkeiten sowie umfassende Untersuchungen auf Wirt-Erreger-Interaktionen.

Im Prinzip ermöglicht das neue System Forschern herauszufinden, wie bestimmte Antibiotika das Wachstum von Pathogenen hemmen, indem sie die Protein-Produktion von anvisierten Genen reduzieren.

konzentrierten, die mit Antibiotika-Resistenz zusammenhängen, zeigten sie in Gammaproteobacteria und Bacillales Firmicutes die Effektivität der mobilen CRISPR-Interferenz auf der Ebene der individuellen Genskala, indem sie Wirkstoff-Gen-Synergien untersuchten, auf der Ebene der genetische Bibliothek durch systematische Phänotypisierung von essentiellen, an der Aminosäuren-Synthese beteiligten Genen.

Die Forscher gehen davon aus, dass die mobile CRISPR-Interferenz eine Transformations-Technologie für Nicht-Model-Bakterien sein wird, bei denen Genanalyse-Werkzeuge fehlen, und dass sie artenübergreifende Genanalysen erleichtern und so die verfügbare  Transposon-Sequenzierungs-Technologie (Tn-seq) ergänzen wird. 

Ihre Forsmchungsbefunde sind in "Nature Microbiology" erschienen.